13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2565 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2565  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  276  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.623984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3923  hypothetical protein  53.62 
 
 
138 aa  147  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119406  decreased coverage  0.00597108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0862  hypothetical protein  44.03 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6479  hypothetical protein  42.31 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0334  hypothetical protein  39.23 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3417  hypothetical protein  47.5 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1755  hypothetical protein  39.39 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1741  hypothetical protein  35.97 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17945  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4654  hypothetical protein  34.07 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1115  hypothetical protein  37.76 
 
 
536 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  36.49 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  30.36 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  36.49 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>