14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1115 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1115  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1060    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6751  hypothetical protein  34.01 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1755  hypothetical protein  38.41 
 
 
138 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1741  hypothetical protein  36.96 
 
 
138 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17945  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6479  hypothetical protein  36.15 
 
 
141 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3923  hypothetical protein  33.58 
 
 
138 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119406  decreased coverage  0.00597108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2565  hypothetical protein  37.76 
 
 
139 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.623984 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0402  hypothetical protein  23.86 
 
 
384 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0334  hypothetical protein  33.08 
 
 
142 aa  57  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4654  hypothetical protein  42.11 
 
 
143 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3609  hypothetical protein  23.86 
 
 
393 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0518753  normal  0.506408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3417  hypothetical protein  36.59 
 
 
85 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2897  hypothetical protein  22.77 
 
 
378 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0918  hypothetical protein  24.61 
 
 
391 aa  44.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00435551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>