10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3417 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3417  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  172  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2565  hypothetical protein  47.5 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.623984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3923  hypothetical protein  46.91 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119406  decreased coverage  0.00597108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0862  hypothetical protein  34.15 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6479  hypothetical protein  42.42 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4654  hypothetical protein  47.54 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1755  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1741  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17945  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1115  hypothetical protein  36.59 
 
 		 536 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0334  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>