11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0334 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0334  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6479  hypothetical protein  69.01 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2565  hypothetical protein  39.23 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.623984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3923  hypothetical protein  41.67 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119406  decreased coverage  0.00597108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4654  hypothetical protein  42.06 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0862  hypothetical protein  37.96 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1741  hypothetical protein  33.85 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17945  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1755  hypothetical protein  33.85 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1115  hypothetical protein  33.08 
 
 		 536 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3417  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08420  hypothetical protein  52.63 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>