194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0374 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0374  cell division protein FtsX  100 
 
 
308 aa  595  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  hitchhiker  0.00757237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3614  protein of unknown function DUF214  46.28 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0731  cell division protein FtsX  41.55 
 
 
299 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3716  cell division protein FtsX  41.14 
 
 
299 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.339466  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2740  hypothetical protein  37.25 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266796  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  39.65 
 
 
301 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  39.65 
 
 
301 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  37.84 
 
 
341 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  38.85 
 
 
341 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  38.51 
 
 
335 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  37.84 
 
 
341 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  37.16 
 
 
341 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  38.18 
 
 
335 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  37.84 
 
 
341 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4173  cell division protein FtsX  39.93 
 
 
338 aa  185  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103974  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48080  Cell division protein FtsX  39.46 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0869301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  37.5 
 
 
344 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  37.84 
 
 
344 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  41 
 
 
330 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  35.1 
 
 
335 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  33.9 
 
 
300 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  31.56 
 
 
326 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03714  cell division protein  36.61 
 
 
316 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2661  cell division protein FtsX  36.27 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467887 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0214  cell division protein  31.68 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0407775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  29.1 
 
 
321 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2990  protein of unknown function DUF214  35.45 
 
 
326 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0625  cell division ABC transporter component permease protein FtsX  30.54 
 
 
328 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.910778  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  29.43 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  29.1 
 
 
321 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 
321 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  29.1 
 
 
321 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  29.1 
 
 
321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03535  cell division protein  32.96 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  28.76 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  28.76 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  28.76 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  32.11 
 
 
351 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2110  efflux ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 
275 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  29.43 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  28.43 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3744  hypothetical protein  36.78 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  29.24 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  30.49 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  29.24 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  29.24 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  28.76 
 
 
321 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  28.76 
 
 
321 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  31.44 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  31.44 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  31.44 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  31.44 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  31.44 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  29.47 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0291  hypothetical protein  28.43 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000447855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  30.51 
 
 
352 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  30.51 
 
 
352 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30.3 
 
 
352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  30.3 
 
 
352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  30.3 
 
 
352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  30.3 
 
 
352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  30.3 
 
 
352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  30.3 
 
 
352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  30.3 
 
 
352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  28.43 
 
 
321 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  30.1 
 
 
317 aa  122  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  27.76 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  29.53 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2303  hypothetical protein  34.22 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2243  cell division protein  32.83 
 
 
312 aa  119  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2154  hypothetical protein  32.83 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.903191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  26.51 
 
 
324 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  29.47 
 
 
322 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  30.11 
 
 
330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1546  protein of unknown function DUF214  26.99 
 
 
327 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3595  cell division protein FtsX  32.71 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00012744  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  30.03 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  26.88 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2722  hypothetical protein  28.67 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2595  hypothetical protein  28.67 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  34.36 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  25.66 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002140  cell division protein FtsX  27.21 
 
 
322 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000746474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 
296 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  22.67 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  25.72 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  24.48 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  29.78 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 
296 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0168  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  30.08 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  32.66 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  23.76 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1100  cell division ABC transporter, permease  28.57 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  31.22 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  28.36 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  27.52 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1243  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.046416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>