16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1000 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1000  N-glycosylase/DNA lyase  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1106  N-glycosylase/DNA lyase  99.52 
 
 		 207 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0807  N-glycosylase/DNA lyase  62.8 
 
 		 208 aa  266  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1811  N-glycosylase/DNA lyase  57.84 
 
 		 204 aa  250  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0202  N-glycosylase/DNA lyase  58.33 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0707  N-glycosylase/DNA lyase  56.46 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0077802  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0692  N-glycosylase/DNA lyase  40 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.871696  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1676  N-glycosylase/DNA lyase  39.58 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.201402  normal  0.189082 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1771  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.17 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000650244  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0474  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.51 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0319  N-glycosylase/DNA lyase  38.97 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.542315  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1885  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.11 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.194701  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0716  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.41 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0507  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.3 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3997  HhH-GPD family protein  26.24 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004306  thermostable 8-oxoguanine DNA glycosylase  29.06 
 
 		 258 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.345989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>