19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0202 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0202  N-glycosylase/DNA lyase  100 
 
 
211 aa  420  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1106  N-glycosylase/DNA lyase  58.82 
 
 
207 aa  245  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1000  N-glycosylase/DNA lyase  58.33 
 
 
207 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0707  N-glycosylase/DNA lyase  54.15 
 
 
218 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0077802  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1811  N-glycosylase/DNA lyase  53.43 
 
 
204 aa  219  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0807  N-glycosylase/DNA lyase  55.45 
 
 
208 aa  217  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0692  N-glycosylase/DNA lyase  41.2 
 
 
222 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.871696  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1676  N-glycosylase/DNA lyase  44.04 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.201402  normal  0.189082 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0474  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.31 
 
 
213 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0319  N-glycosylase/DNA lyase  32.7 
 
 
215 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.542315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1771  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.58 
 
 
218 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000650244  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1885  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.57 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.194701  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0716  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.94 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0507  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.99 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3997  HhH-GPD family protein  26.19 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004306  thermostable 8-oxoguanine DNA glycosylase  28.42 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.345989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2517  hypothetical protein  30.14 
 
 
244 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4045  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0338  hypothetical protein  33.06 
 
 
240 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>