15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004306 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004306  thermostable 8-oxoguanine DNA glycosylase  100 
 
 		 258 aa  543  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.345989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2517  hypothetical protein  36.52 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4045  hypothetical protein  35.37 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0338  hypothetical protein  33.19 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1771  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.27 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000650244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3997  HhH-GPD family protein  26.67 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0202  N-glycosylase/DNA lyase  28.42 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1106  N-glycosylase/DNA lyase  29.91 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0474  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.33 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0319  N-glycosylase/DNA lyase  25.41 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.542315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1000  N-glycosylase/DNA lyase  29.06 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0716  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.29 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1676  N-glycosylase/DNA lyase  31.93 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.201402  normal  0.189082 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1811  N-glycosylase/DNA lyase  30.17 
 
 		 204 aa  45.4  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0707  N-glycosylase/DNA lyase  24.47 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0077802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>