25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0047 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0047  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0283317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  28.57 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  25.57 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  28.02 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  26.92 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  26.92 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  26.92 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  26.92 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  25.41 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  26.92 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  26.37 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  27.75 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  26.49 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  26.51 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  25.27 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  28.25 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  23.37 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  26.37 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  24.73 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  34.12 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  24 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  23.53 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  21.79 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  25.42 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  23.2 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>