31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10997 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10997  50S ribosomal protein L32  100 
 
 
57 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.6896799999999995e-25  normal  0.590269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4302  50S ribosomal protein L32  85.96 
 
 
57 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4388  50S ribosomal protein L32  85.96 
 
 
57 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4682  50S ribosomal protein L32  85.96 
 
 
57 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.32504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4845  50S ribosomal protein L32  80.7 
 
 
57 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784807  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1886  50S ribosomal protein L32  77.19 
 
 
57 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3288  ribosomal protein L32  64.91 
 
 
57 aa  77  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.541236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1386  ribosomal protein L32  63.16 
 
 
57 aa  72.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4160  50S ribosomal protein L32  62.26 
 
 
58 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1558  ribosomal protein L32  61.54 
 
 
56 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900428  decreased coverage  0.00889428 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21540  LSU ribosomal protein L32P  57.41 
 
 
54 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0096297  hitchhiker  0.000173407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13280  LSU ribosomal protein L32P  54.55 
 
 
56 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0352088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4414  ribosomal protein L32  58.49 
 
 
53 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000688865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2781  50S ribosomal protein L32  73.33 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3434  ribosomal protein L32  66.67 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.976937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0211  ribosomal protein L32  70 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5965  50S ribosomal protein L32  67.74 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1575  50S ribosomal protein L32  78.57 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0654579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2240  50S ribosomal protein L32  62.86 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000311506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2502  50S ribosomal protein L32  62.86 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.801451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0650  50S ribosomal protein L32  70 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1285  50S ribosomal protein L32  66.67 
 
 
57 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2274  ribosomal protein L32  71.43 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2615  ribosomal protein L32  48.08 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.499524 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08890  50S ribosomal protein L32  71.43 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1608  50S ribosomal protein L32  51.06 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1175  50S ribosomal protein L32  66.67 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000516362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1137  50S ribosomal protein L32  67.74 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131577  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  67.86 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4030  ribosomal protein L32  67.86 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11280  LSU ribosomal protein L32P  67.86 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0246077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>