19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2112 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2112  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  346  9e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.229399  normal  0.697111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1996  dithiobiotin synthetase  31.39 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4370  dethiobiotin synthase  31.84 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.497713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4689  dithiobiotin synthetase  28.89 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2678  dithiobiotin synthetase  31.82 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3426  dithiobiotin synthetase  31.82 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  27.9 
 
 
244 aa  61.6  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1373  dithiobiotin synthetase  40.74 
 
 
226 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.265061  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  28.33 
 
 
225 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  21.57 
 
 
228 aa  48.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  41.54 
 
 
262 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  41.54 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  30 
 
 
241 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  29.41 
 
 
249 aa  44.7  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  22.5 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.65 
 
 
429 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  27.88 
 
 
242 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  29.17 
 
 
242 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  31.37 
 
 
210 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>