18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1706 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1706  hypothetical protein  100 
 
 
730 aa  1434    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.533285  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1724  hypothetical protein  34.33 
 
 
847 aa  358  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3002  hypothetical protein  34.59 
 
 
885 aa  351  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.598008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3278  hypothetical protein  34.35 
 
 
848 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2843  hypothetical protein  34.35 
 
 
848 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.1324  normal  0.0381219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5033  OstA family protein  32.84 
 
 
833 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.589653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3195  hypothetical protein  33.28 
 
 
871 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2085  OstA family protein  33.02 
 
 
687 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24661  hypothetical protein  26.22 
 
 
1063 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02801  hypothetical protein  27.17 
 
 
734 aa  183  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0259  hypothetical protein  27.04 
 
 
928 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0256  hypothetical protein  25.04 
 
 
643 aa  171  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.68004  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2085  hypothetical protein  26.41 
 
 
959 aa  171  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.85609  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03321  hypothetical protein  24.1 
 
 
644 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.377617  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1620  hypothetical protein  23.94 
 
 
645 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02761  hypothetical protein  22.17 
 
 
633 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0749184  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02871  hypothetical protein  22.1 
 
 
594 aa  90.5  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0260659  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14461  hypothetical protein  26.82 
 
 
756 aa  74.3  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>