20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1555 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1555  Thf1-like protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0657894  normal  0.198301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4577  Thf1-like protein  52.05 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2617  photosystem II biogenesis protein Psp29  49.78 
 
 		 235 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5166  Thf1-like protein  49.14 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.277689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5175  Thf1-like protein  47.75 
 
 		 226 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1173  Thf1-like protein  46.12 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1143  Thf1-like protein  46.12 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1168  Thf1-like protein  43.36 
 
 		 239 aa  205  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.73706  decreased coverage  0.000261237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15471  Thf1-like protein  39.34 
 
 		 250 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1441  Thf1-like protein  38.91 
 
 		 215 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.525764  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1058  Thf1-like protein  36.65 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0565154  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08431  Thf1-like protein  29.22 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.171667  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08021  Thf1-like protein  28.11 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09631  Thf1-like protein  28.28 
 
 		 199 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0866788 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0291  Thf1-like protein  27.78 
 
 		 199 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.550291  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08011  Thf1-like protein  28.29 
 
 		 217 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08431  Thf1-like protein  28.9 
 
 		 217 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0749  Thf1-like protein  26.76 
 
 		 216 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6426  predicted protein  29.09 
 
 		 203 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37959  predicted protein  26.47 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>