20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1058 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1058  Thf1-like protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0565154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1441  Thf1-like protein  61.86 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.525764  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15471  Thf1-like protein  44.89 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0291  Thf1-like protein  41.71 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.550291  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09631  Thf1-like protein  41.71 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0866788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1555  Thf1-like protein  36.7 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0657894  normal  0.198301 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08431  Thf1-like protein  33.49 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.171667  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08021  Thf1-like protein  33.17 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5175  Thf1-like protein  33.04 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1143  Thf1-like protein  33.19 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1173  Thf1-like protein  33.19 
 
 		 235 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5166  Thf1-like protein  29.73 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.277689 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08011  Thf1-like protein  33.16 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08431  Thf1-like protein  32.2 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4577  Thf1-like protein  30.59 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0749  Thf1-like protein  32.66 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1168  Thf1-like protein  32.77 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.73706  decreased coverage  0.000261237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2617  photosystem II biogenesis protein Psp29  28.83 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6426  predicted protein  26.54 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37959  predicted protein  21.43 
 
 		 311 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>