21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2033 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2033  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  551  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0309  hypothetical protein  51.8 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03881  abortive infection protein  41.13 
 
 
288 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16201  hypothetical protein  43.37 
 
 
276 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03891  abortive infection protein  41.43 
 
 
294 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.108857  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0359  abortive infection protein  35.59 
 
 
286 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.716019  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19391  abortive infection protein  35.88 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03871  abortive infection protein  37.31 
 
 
286 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1064  metal-dependent membrane protease  35.29 
 
 
283 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.229684  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23761  abortive infection protein  46.5 
 
 
261 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0943481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1274  abortive infection protein  28.75 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0674  abortive infection protein  28.27 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.988034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1156  Abortive infection protein  31.35 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1185  Abortive infection protein  31.35 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000260265  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3402  Abortive infection protein  26.84 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0689  hypothetical protein  29.33 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.605794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0525  abortive infection protein  34.51 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1639  Abortive infection protein  26.96 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.153184 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  30.17 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  28.15 
 
 
292 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  32.05 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>