23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0689 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0689  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  528  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.605794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1274  abortive infection protein  40.59 
 
 
276 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0674  abortive infection protein  39.17 
 
 
277 aa  139  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.988034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1122  abortive infection protein  37.9 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90846  hitchhiker  0.0094242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3402  Abortive infection protein  43.24 
 
 
278 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1185  Abortive infection protein  39.41 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000260265  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1156  Abortive infection protein  38.56 
 
 
268 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1639  Abortive infection protein  39.35 
 
 
279 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.153184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0525  abortive infection protein  34.94 
 
 
273 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03881  abortive infection protein  29 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5328  Abortive infection protein  29.73 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19391  abortive infection protein  28.15 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1064  metal-dependent membrane protease  29.06 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.229684  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0062  abortive infection protein  31.39 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0359  abortive infection protein  29.68 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.716019  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16201  hypothetical protein  30.94 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0397  Abortive infection protein  34.54 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0406  Abortive infection protein  34.72 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03871  abortive infection protein  30.77 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2033  hypothetical protein  29.72 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0309  hypothetical protein  29.07 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03891  abortive infection protein  28.22 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.108857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  23.38 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>