36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1064 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1064  metal-dependent membrane protease  100 
 
 
283 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.229684  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19391  abortive infection protein  88.34 
 
 
283 aa  497  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16201  hypothetical protein  36.36 
 
 
276 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03881  abortive infection protein  36.7 
 
 
288 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03891  abortive infection protein  38.91 
 
 
294 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.108857  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0309  hypothetical protein  37.41 
 
 
290 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0359  abortive infection protein  36.47 
 
 
286 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.716019  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03871  abortive infection protein  37.18 
 
 
286 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2033  hypothetical protein  35.11 
 
 
287 aa  135  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23761  abortive infection protein  38.46 
 
 
261 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0943481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0674  abortive infection protein  27.47 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.988034  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1185  Abortive infection protein  26.58 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000260265  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0525  abortive infection protein  34.72 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1156  Abortive infection protein  25.74 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1122  abortive infection protein  29.15 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90846  hitchhiker  0.0094242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1274  abortive infection protein  30.91 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0689  hypothetical protein  29.17 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.605794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3402  Abortive infection protein  26.8 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1639  Abortive infection protein  33.33 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.153184 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  37 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.17 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0062  abortive infection protein  28 
 
 
290 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  31.17 
 
 
313 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  31.17 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  31.17 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  31.17 
 
 
337 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.17 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  31.17 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.17 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  31.17 
 
 
337 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  31.17 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.17 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0406  Abortive infection protein  31.3 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0397  Abortive infection protein  32.59 
 
 
285 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  38.82 
 
 
453 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  38.82 
 
 
453 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>