17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1437 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1437  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  998    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16411  hypothetical protein  28.82 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  29.87 
 
 		 219 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  25.64 
 
 		 507 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  28.3 
 
 		 686 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  34.31 
 
 		 982 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  34.43 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.1 
 
 		 4798 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  30.49 
 
 		 724 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 3427 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  34.62 
 
 		 14829 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  31.72 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.82 
 
 		 1016 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  30.47 
 
 		 327 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.04 
 
 		 980 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.67 
 
 		 9867 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  30.19 
 
 		 1029 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>