20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0301a on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0301a  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  170  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2391  hypothetical protein  75.61 
 
 
83 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26601  putative Ycf34  75.61 
 
 
92 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1506  putative Ycf34  60.98 
 
 
83 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02121  putative Ycf34  59.76 
 
 
83 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01551  putative Ycf34  57.83 
 
 
83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12681  hypothetical protein  52.44 
 
 
83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.276714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01681  putative Ycf34  47.56 
 
 
83 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1460  hypothetical protein  52.94 
 
 
85 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0271116  decreased coverage  0.00664473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0760  hypothetical protein  50.6 
 
 
82 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01571  putative Ycf34  46.34 
 
 
83 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01591  putative Ycf34  46.34 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0185  hypothetical protein  50.6 
 
 
82 aa  95.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.716458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1998  hypothetical protein  51.19 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458681  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1971  Ycf34  51.19 
 
 
82 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3834  hypothetical protein  49.4 
 
 
82 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0142  putative Ycf34  45.12 
 
 
83 aa  93.2  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2998  putative protein Ycf34  49.4 
 
 
82 aa  93.6  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.598628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1063  hypothetical protein  46.99 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31741  predicted protein  45.65 
 
 
148 aa  47  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.74316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>