20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01681 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_01681  putative Ycf34  100 
 
 
83 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01591  putative Ycf34  75.9 
 
 
83 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108018  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01571  putative Ycf34  74.7 
 
 
83 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0142  putative Ycf34  69.88 
 
 
83 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12681  hypothetical protein  60.24 
 
 
83 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.276714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2391  hypothetical protein  53.66 
 
 
83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301a  hypothetical protein  47.56 
 
 
83 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26601  putative Ycf34  48.78 
 
 
92 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01551  putative Ycf34  50 
 
 
83 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1506  putative Ycf34  47.56 
 
 
83 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1460  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0271116  decreased coverage  0.00664473 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02121  putative Ycf34  46.34 
 
 
83 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0185  hypothetical protein  48.19 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.716458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1063  hypothetical protein  46.99 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1998  hypothetical protein  48.19 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458681  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1971  Ycf34  48.19 
 
 
82 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0760  hypothetical protein  43.37 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3834  hypothetical protein  46.99 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2998  putative protein Ycf34  43.37 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.598628  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31741  predicted protein  43.48 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.74316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>