20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01571 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_01571  putative Ycf34  100 
 
 		 83 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01591  putative Ycf34  97.59 
 
 		 83 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108018  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0142  putative Ycf34  86.75 
 
 		 83 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01681  putative Ycf34  74.7 
 
 		 83 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12681  hypothetical protein  59.04 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.276714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2391  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301a  hypothetical protein  46.34 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01551  putative Ycf34  49.4 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1506  putative Ycf34  47.56 
 
 		 83 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02121  putative Ycf34  48.78 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26601  putative Ycf34  45.12 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1460  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0271116  decreased coverage  0.00664473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1998  hypothetical protein  51.19 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458681  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1971  Ycf34  51.19 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1063  hypothetical protein  48.19 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3834  hypothetical protein  46.99 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0185  hypothetical protein  48.19 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.716458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0760  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2998  putative protein Ycf34  44.58 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.598628  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31741  predicted protein  31.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.74316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>