20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_02121 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_02121  putative Ycf34  100 
 
 
83 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1506  putative Ycf34  84.34 
 
 
83 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301a  hypothetical protein  59.76 
 
 
83 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2391  hypothetical protein  56.63 
 
 
83 aa  120  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01551  putative Ycf34  63.41 
 
 
83 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26601  putative Ycf34  56.63 
 
 
92 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12681  hypothetical protein  48.78 
 
 
83 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.276714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0760  hypothetical protein  55.42 
 
 
82 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1460  hypothetical protein  51.19 
 
 
85 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0271116  decreased coverage  0.00664473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1063  hypothetical protein  54.88 
 
 
82 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3834  hypothetical protein  54.88 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0185  hypothetical protein  54.22 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.716458 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01591  putative Ycf34  48.78 
 
 
83 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108018  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01681  putative Ycf34  46.34 
 
 
83 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01571  putative Ycf34  48.78 
 
 
83 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2998  putative protein Ycf34  53.66 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.598628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1971  Ycf34  51.22 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1998  hypothetical protein  51.22 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458681  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0142  putative Ycf34  45.12 
 
 
83 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31741  predicted protein  43.48 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.74316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>