19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0142 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0142  putative Ycf34  100 
 
 
83 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01591  putative Ycf34  87.95 
 
 
83 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108018  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01571  putative Ycf34  86.75 
 
 
83 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01681  putative Ycf34  69.88 
 
 
83 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12681  hypothetical protein  57.83 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.276714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2391  hypothetical protein  48.78 
 
 
83 aa  98.6  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26601  putative Ycf34  45.12 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01551  putative Ycf34  46.99 
 
 
83 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301a  hypothetical protein  45.12 
 
 
83 aa  93.2  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1506  putative Ycf34  45.12 
 
 
83 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02121  putative Ycf34  45.12 
 
 
83 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0185  hypothetical protein  46.99 
 
 
82 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.716458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1063  hypothetical protein  45.78 
 
 
82 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1460  hypothetical protein  43.53 
 
 
85 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0271116  decreased coverage  0.00664473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1971  Ycf34  46.99 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1998  hypothetical protein  46.99 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458681  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3834  hypothetical protein  45.78 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2998  putative protein Ycf34  44.58 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.598628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0760  hypothetical protein  42.17 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.388862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>