14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3896 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3896  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  274  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5513  hypothetical protein  33.64 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0363  hypothetical protein  32.79 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0245  hypothetical protein  33.61 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0245  hypothetical protein  36.19 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0248  hypothetical protein  36.19 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0251  hypothetical protein  34.29 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000141062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0246  hypothetical protein  33.63 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3038  hypothetical protein  26.42 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5761  hypothetical protein  29.63 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3385  hypothetical protein  24.53 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0247  hypothetical protein  31.86 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4481  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3775  hypothetical protein  30.09 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>