16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4481 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4481  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  344  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0247  hypothetical protein  63.92 
 
 		 162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0246  hypothetical protein  62.03 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0245  hypothetical protein  59.64 
 
 		 170 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0245  hypothetical protein  59.64 
 
 		 170 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0248  hypothetical protein  59.04 
 
 		 167 aa  198  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3775  hypothetical protein  61.39 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0251  hypothetical protein  57.06 
 
 		 167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000141062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0363  hypothetical protein  56.44 
 
 		 167 aa  190  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3896  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3038  hypothetical protein  30.51 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5761  hypothetical protein  33 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5513  hypothetical protein  31.08 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3385  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0249  hypothetical protein  32.99 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1351  hypothetical protein  24.62 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0172472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>