15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0246 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0246  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  336  8e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3775  hypothetical protein  93.83 
 
 		 162 aa  317  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0247  hypothetical protein  90.74 
 
 		 162 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4481  hypothetical protein  62.03 
 
 		 167 aa  206  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0245  hypothetical protein  54.88 
 
 		 170 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0245  hypothetical protein  54.88 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0248  hypothetical protein  54.27 
 
 		 167 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0363  hypothetical protein  54.88 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0251  hypothetical protein  54.88 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000141062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3896  hypothetical protein  33.63 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5761  hypothetical protein  35.4 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3385  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5513  hypothetical protein  30.85 
 
 		 141 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0249  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3038  hypothetical protein  32.26 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>