13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0247 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0247  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  335  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0246  hypothetical protein  90.74 
 
 		 162 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3775  hypothetical protein  90.74 
 
 		 162 aa  308  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4481  hypothetical protein  63.92 
 
 		 167 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0245  hypothetical protein  56.1 
 
 		 170 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0245  hypothetical protein  56.1 
 
 		 170 aa  183  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0248  hypothetical protein  55.49 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0363  hypothetical protein  55.49 
 
 		 167 aa  180  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0251  hypothetical protein  55.49 
 
 		 167 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000141062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3896  hypothetical protein  31.86 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3385  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5761  hypothetical protein  32.74 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5513  hypothetical protein  30.85 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>