62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3214 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
135 aa  271  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.521696  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1038  putative glyoxalase I  55.12 
 
 
136 aa  149  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3284  hypothetical protein  41.18 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88163  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1275  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.1 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
127 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1264  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0246798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464949  normal  0.0262279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6216  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.91 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.86 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 
126 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3565  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  32.12 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  28.79 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2910  lactoylglutathione lyase, glyoxylase family protein  27.27 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.616957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1685  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5312  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3087  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  28.93 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2866  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.23 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1533  fosfomycin resistance protein FosB  28.12 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.95 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  29.63 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0839  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.96 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3244  glyoxylase family protein  26.52 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.201718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3217  glyoxylase family protein  26.52 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2983  glyoxylase family protein  26.52 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0178  lactoylglutathione lyase related lyase  28.24 
 
 
126 aa  42  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00765749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.67 
 
 
168 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2976  lactoylglutathione lyase, glyoxylase family protein  25.76 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3208  glyoxylase family protein  26.52 
 
 
130 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.77 
 
 
168 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 
126 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3200  glyoxylase family protein  26.52 
 
 
130 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.77 
 
 
168 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  26.28 
 
 
130 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.76 
 
 
130 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  30.47 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  29.32 
 
 
238 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3007  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.16 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3232  glyoxylase family protein  25.76 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0683516  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  28.57 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.98 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  30.53 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1884  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 
126 aa  40.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.173624  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0848  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0838  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.14 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2038  glyoxylase family protein  25.76 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  35.82 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0026  glyoxalase family protein  28.24 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  28.57 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  28.79 
 
 
129 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  28.79 
 
 
129 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  28.79 
 
 
129 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  28.79 
 
 
129 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  28.79 
 
 
129 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  28.79 
 
 
129 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>