22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0558 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0558  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  163  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0673  hypothetical protein  89.02 
 
 		 83 aa  147  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3380  hypothetical protein  87.8 
 
 		 83 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.833819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0573  hypothetical protein  87.8 
 
 		 83 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0491  hypothetical protein  86.75 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3550  hypothetical protein  86.59 
 
 		 83 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0721  hypothetical protein  85.54 
 
 		 83 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3660  hypothetical protein  84.15 
 
 		 83 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3364  hypothetical protein  84.15 
 
 		 83 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3243  hypothetical protein  80.49 
 
 		 83 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0674  hypothetical protein  79.52 
 
 		 83 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0682  hypothetical protein  79.52 
 
 		 83 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3702  hypothetical protein  79.52 
 
 		 83 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3640  hypothetical protein  80.49 
 
 		 83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0653  hypothetical protein  77.11 
 
 		 83 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0749  hypothetical protein  72.84 
 
 		 87 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04768  hypothetical protein  69.88 
 
 		 88 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3291  hypothetical protein  67.07 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141883  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000252  hypothetical protein  70.73 
 
 		 83 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0530  hypothetical protein  67.07 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000854273  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0211  hypothetical protein  65.85 
 
 		 83 aa  110  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2389  hypothetical protein  54.88 
 
 		 85 aa  96.7  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>