22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3291 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3291  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141883  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0530  hypothetical protein  71.95 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000854273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3660  hypothetical protein  70.73 
 
 
83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0673  hypothetical protein  69.51 
 
 
83 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3380  hypothetical protein  69.51 
 
 
83 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.833819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0573  hypothetical protein  69.51 
 
 
83 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0721  hypothetical protein  69.51 
 
 
83 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3550  hypothetical protein  68.29 
 
 
83 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0491  hypothetical protein  69.51 
 
 
84 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0558  hypothetical protein  67.07 
 
 
83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3364  hypothetical protein  69.51 
 
 
83 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3243  hypothetical protein  69.51 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0674  hypothetical protein  68.29 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0682  hypothetical protein  68.29 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04768  hypothetical protein  65.06 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3702  hypothetical protein  68.29 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0749  hypothetical protein  61.63 
 
 
87 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000252  hypothetical protein  65.85 
 
 
83 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0653  hypothetical protein  65.85 
 
 
83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3640  hypothetical protein  67.07 
 
 
83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0211  hypothetical protein  59.76 
 
 
83 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2389  hypothetical protein  57.32 
 
 
85 aa  100  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>