22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2389 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2389  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0530  hypothetical protein  74.12 
 
 
85 aa  133  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000854273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0721  hypothetical protein  62.65 
 
 
83 aa  104  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3380  hypothetical protein  62.65 
 
 
83 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.833819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0573  hypothetical protein  62.65 
 
 
83 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0211  hypothetical protein  57.83 
 
 
83 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773178  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0749  hypothetical protein  55.29 
 
 
87 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000252  hypothetical protein  59.04 
 
 
83 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04768  hypothetical protein  59.76 
 
 
88 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3660  hypothetical protein  57.83 
 
 
83 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3550  hypothetical protein  61.45 
 
 
83 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0673  hypothetical protein  60.24 
 
 
83 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3364  hypothetical protein  59.04 
 
 
83 aa  100  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3291  hypothetical protein  57.32 
 
 
86 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141883  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3702  hypothetical protein  60.24 
 
 
83 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0491  hypothetical protein  58.33 
 
 
84 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0682  hypothetical protein  60.24 
 
 
83 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0674  hypothetical protein  60.24 
 
 
83 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3640  hypothetical protein  57.32 
 
 
83 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0653  hypothetical protein  59.04 
 
 
83 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0558  hypothetical protein  54.88 
 
 
83 aa  96.7  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3243  hypothetical protein  55.42 
 
 
83 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>