22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0573 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3380  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.833819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0573  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3550  hypothetical protein  98.8 
 
 
83 aa  160  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0721  hypothetical protein  98.8 
 
 
83 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0491  hypothetical protein  91.57 
 
 
84 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0673  hypothetical protein  87.95 
 
 
83 aa  147  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0558  hypothetical protein  87.8 
 
 
83 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0674  hypothetical protein  86.75 
 
 
83 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0682  hypothetical protein  86.75 
 
 
83 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3702  hypothetical protein  86.75 
 
 
83 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3243  hypothetical protein  85.54 
 
 
83 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3364  hypothetical protein  86.75 
 
 
83 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0653  hypothetical protein  84.34 
 
 
83 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3660  hypothetical protein  83.13 
 
 
83 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3640  hypothetical protein  79.27 
 
 
83 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0749  hypothetical protein  73.49 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04768  hypothetical protein  71.08 
 
 
88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3291  hypothetical protein  69.51 
 
 
86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141883  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0530  hypothetical protein  71.08 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000854273  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000252  hypothetical protein  69.88 
 
 
83 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0211  hypothetical protein  67.47 
 
 
83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2389  hypothetical protein  62.65 
 
 
85 aa  104  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>