22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0491 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0491  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0721  hypothetical protein  92.77 
 
 		 83 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3380  hypothetical protein  91.57 
 
 		 83 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.833819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0573  hypothetical protein  91.57 
 
 		 83 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0673  hypothetical protein  90.36 
 
 		 83 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3550  hypothetical protein  90.36 
 
 		 83 aa  147  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0558  hypothetical protein  86.75 
 
 		 83 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0674  hypothetical protein  87.95 
 
 		 83 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0682  hypothetical protein  87.95 
 
 		 83 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3702  hypothetical protein  87.95 
 
 		 83 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0653  hypothetical protein  85.54 
 
 		 83 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3660  hypothetical protein  85.54 
 
 		 83 aa  140  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3243  hypothetical protein  84.34 
 
 		 83 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3364  hypothetical protein  85.54 
 
 		 83 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0749  hypothetical protein  78.57 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3640  hypothetical protein  81.71 
 
 		 83 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04768  hypothetical protein  73.17 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0530  hypothetical protein  70.24 
 
 		 85 aa  117  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000854273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3291  hypothetical protein  69.51 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141883  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0211  hypothetical protein  68.67 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773178  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000252  hypothetical protein  71.08 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2389  hypothetical protein  58.33 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>