110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5200 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1505  nitric oxide reductase subunit B  54.02 
 
 
756 aa  783    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0794416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0633  nitric oxide reductase norZ, putative  53.05 
 
 
762 aa  806    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5055  nitric oxide reductase large subunit  52.05 
 
 
761 aa  747    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2802  nitric oxide reductase, subunit B  53.05 
 
 
762 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1813  nitric oxide reductase  53.85 
 
 
762 aa  807    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3720  putative nitric-oxide reductase  57.57 
 
 
763 aa  813    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1886  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  53.94 
 
 
774 aa  810    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3167  nitric oxide reductase large subunit  52.7 
 
 
759 aa  768    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0364  putative nitric-oxide reductase  55.15 
 
 
761 aa  813    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596317  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3089  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  54.72 
 
 
761 aa  796    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0963858  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0883  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  54.86 
 
 
761 aa  790    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0356599  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3253  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  55.68 
 
 
762 aa  805    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0846  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  54.72 
 
 
761 aa  792    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00975115  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0728  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  54.8 
 
 
758 aa  798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1328  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  51.58 
 
 
758 aa  800    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126926  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0092  nitric oxide reductase large subunit  50.54 
 
 
768 aa  743    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5786  putative nitric-oxide reductase  53.06 
 
 
748 aa  792    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2379  putative nitric oxide reductase norZ  53.05 
 
 
762 aa  806    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2908  putative nitric oxide reductase norZ  53.05 
 
 
762 aa  806    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2680  hypothetical protein  52.92 
 
 
762 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2738  hypothetical protein  53.05 
 
 
762 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1694  putative nitric oxide reductase norZ  53.05 
 
 
762 aa  806    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.732748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0657  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  55.35 
 
 
763 aa  793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3072  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  55.44 
 
 
761 aa  816    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.493365  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2413  nitric oxide reductase large subunit-like protein  54.21 
 
 
744 aa  830    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5200  putative nitric-oxide reductase  100 
 
 
759 aa  1515    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4614  nitric oxide reductase large subunit-like protein  52.91 
 
 
756 aa  755    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0294129  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1520  nitric oxide reductase large subunit-like protein  47.02 
 
 
759 aa  726    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3848  putative nitric-oxide reductase  58.3 
 
 
764 aa  824    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1608  hypothetical protein  48.58 
 
 
746 aa  702    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1004  putative nitric-oxide reductase  65.53 
 
 
769 aa  985    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.138313  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3044  putative nitric-oxide reductase  56.46 
 
 
767 aa  822    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0283046  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1535  arginyl-tRNA synthetase (arginine--tRNA ligase; ArgRS)  47.22 
 
 
743 aa  702    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0453039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3822  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  55.21 
 
 
761 aa  794    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0625212  hitchhiker  0.000200151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0761  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  56.14 
 
 
762 aa  823    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4013  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  52.96 
 
 
758 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.23875  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3777  putative nitric-oxide reductase  57.38 
 
 
763 aa  811    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3860  putative nitric-oxide reductase  57.38 
 
 
763 aa  813    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0109  nitric oxide reductase large subunit  50.67 
 
 
768 aa  729    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.229583  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1575  nitric oxide reductase large subunit-like protein  53 
 
 
747 aa  798    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.362479  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4126  nitric oxide reductase subunit B  52.96 
 
 
758 aa  775    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2427  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  45.49 
 
 
760 aa  612  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376989  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1403  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  45.86 
 
 
762 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2454  Nitric-oxide reductase  45.99 
 
 
762 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2550  Nitric-oxide reductase  45.85 
 
 
762 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3493  nitric-oxide reductase subunit B  42.82 
 
 
756 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2932  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  44.28 
 
 
758 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28590  nitric oxide reductase large subunit  39.07 
 
 
840 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1556  Nitric-oxide reductase  37.77 
 
 
787 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3901  nitric oxide reductase  38.95 
 
 
763 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3986  nitric oxide reductase  39.03 
 
 
762 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3302  cytochrome c oxidase subunit I  39.87 
 
 
769 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3178  cytochrome c oxidase, subunit I  39.6 
 
 
769 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1569  nitric-oxide reductase subunit B  40.19 
 
 
783 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1593  nitric-oxide reductase subunit B  40.19 
 
 
783 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.718907  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1539  nitric-oxide reductase subunit B  40.33 
 
 
783 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0778717  normal  0.182091 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0873  Nitric-oxide reductase  35.57 
 
 
1077 aa  441  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0182  Nitric-oxide reductase  33.99 
 
 
776 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1980  Nitric-oxide reductase  33.99 
 
 
762 aa  417  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187337  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1902  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  35.2 
 
 
763 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.960689  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0945  nitric oxide reductase  37.37 
 
 
773 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33419  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2162  hypothetical protein  34.85 
 
 
780 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2060  nitric oxide reductase  36.93 
 
 
773 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2189  hypothetical protein  34.72 
 
 
780 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0799  nitric oxide reductase  36.66 
 
 
772 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0547  nitric oxide reductase  36.66 
 
 
772 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0658  nitric oxide reductase  36.66 
 
 
772 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.971693  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1965  nitric oxide reductase large subunit  42.28 
 
 
518 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.575096  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0472  Nitric-oxide reductase  29.18 
 
 
739 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000690238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0474  nitric oxide reductase  35.62 
 
 
683 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0351  Nitric-oxide reductase  30.43 
 
 
748 aa  285  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000483731  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1908  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  27.98 
 
 
720 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0502  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  27.16 
 
 
734 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2401  nitric oxide reductase large subunit-like protein protein  25.78 
 
 
706 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0286  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  26.15 
 
 
731 aa  145  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00622687 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2483  cytochrome c oxidase, subunit I  26.71 
 
 
462 aa  125  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1642  Nitric-oxide reductase  26.64 
 
 
448 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4387  nitric-oxide reductase  25.49 
 
 
448 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3034  Nitric-oxide reductase  26.54 
 
 
457 aa  114  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1248  cytochrome c oxidase subunit I  26.15 
 
 
457 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.883725  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0249  nitric-oxide reductase, large subunit  25 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2118  cytochrome c oxidase, subunit I  26.62 
 
 
447 aa  110  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  26.25 
 
 
460 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6288  nitric-oxide reductase  24.58 
 
 
448 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2758  nitric-oxide reductase  28.73 
 
 
452 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2400  nitric-oxide reductase, B subunit, putative  26.79 
 
 
481 aa  106  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2089  nitric-oxide reductase subunit B  25.86 
 
 
448 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1516  Nitric-oxide reductase  26.32 
 
 
451 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1468  cytochrome c oxidase subunit I  28.05 
 
 
483 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153062 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1984  nitric-oxide reductase subunit NorB  25.06 
 
 
474 aa  103  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000788431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0625  nitric-oxide reductase subunit B  27.06 
 
 
465 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0561  nitric-oxide reductase subunit B  25.16 
 
 
467 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000153922  normal  0.745832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06830  nitric-oxide reductase subunit B  26.84 
 
 
465 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0601  nitric-oxide reductase, B subunit  25.49 
 
 
463 aa  99.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3184  nitric oxide reductase subunit B  24.42 
 
 
459 aa  99  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500001  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2598  Nitric-oxide reductase  25.81 
 
 
460 aa  97.8  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605151  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0971  nitric-oxide reductase  24.8 
 
 
446 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.838471  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0323  nitric oxide reductase large subunit, cytochrome b  24.51 
 
 
446 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1980  cytochrome c oxidase, subunit I  26.98 
 
 
471 aa  95.1  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3115  cytochrome c oxidase, subunit I  24.95 
 
 
471 aa  95.5  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.86762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>