111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1569 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3178  cytochrome c oxidase, subunit I  60.08 
 
 
769 aa  847    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1569  nitric-oxide reductase subunit B  100 
 
 
783 aa  1575    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1593  nitric-oxide reductase subunit B  100 
 
 
783 aa  1575    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.718907  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28590  nitric oxide reductase large subunit  66.49 
 
 
840 aa  1055    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1539  nitric-oxide reductase subunit B  99.23 
 
 
783 aa  1567    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0778717  normal  0.182091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3986  nitric oxide reductase  52.3 
 
 
762 aa  743    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3302  cytochrome c oxidase subunit I  59.95 
 
 
769 aa  846    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3901  nitric oxide reductase  52.17 
 
 
763 aa  746    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3493  nitric-oxide reductase subunit B  46.19 
 
 
756 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0364  putative nitric-oxide reductase  40 
 
 
761 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596317  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3720  putative nitric-oxide reductase  39.27 
 
 
763 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3860  putative nitric-oxide reductase  39.22 
 
 
763 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3777  putative nitric-oxide reductase  39.3 
 
 
763 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3044  putative nitric-oxide reductase  38.88 
 
 
767 aa  502  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0283046  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4614  nitric oxide reductase large subunit-like protein  40.53 
 
 
756 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0294129  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2413  nitric oxide reductase large subunit-like protein  36.71 
 
 
744 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2427  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  40.03 
 
 
760 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376989  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3848  putative nitric-oxide reductase  39.15 
 
 
764 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1403  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  39.65 
 
 
762 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3167  nitric oxide reductase large subunit  39.73 
 
 
759 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5200  putative nitric-oxide reductase  40.19 
 
 
759 aa  488  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2454  Nitric-oxide reductase  39.78 
 
 
762 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2550  Nitric-oxide reductase  39.78 
 
 
762 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0728  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.78 
 
 
758 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0657  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.94 
 
 
763 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3072  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.39 
 
 
761 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.493365  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1520  nitric oxide reductase large subunit-like protein  38.27 
 
 
759 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0761  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.29 
 
 
762 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3089  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  39.16 
 
 
761 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0963858  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0846  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  39.43 
 
 
761 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00975115  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1004  putative nitric-oxide reductase  39.35 
 
 
769 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.138313  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1505  nitric oxide reductase subunit B  38.96 
 
 
756 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0794416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5786  putative nitric-oxide reductase  38.75 
 
 
748 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0883  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  39.3 
 
 
761 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0356599  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3253  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  37.87 
 
 
762 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4126  nitric oxide reductase subunit B  38.78 
 
 
758 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4013  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.78 
 
 
758 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.23875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1886  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  37.4 
 
 
774 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549949  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1535  arginyl-tRNA synthetase (arginine--tRNA ligase; ArgRS)  37.91 
 
 
743 aa  472  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0453039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1328  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  36.95 
 
 
758 aa  472  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126926  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1575  nitric oxide reductase large subunit-like protein  35.86 
 
 
747 aa  469  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.362479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2932  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  39.89 
 
 
758 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1608  hypothetical protein  38.15 
 
 
746 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0633  nitric oxide reductase norZ, putative  37.32 
 
 
762 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5055  nitric oxide reductase large subunit  39.42 
 
 
761 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2802  nitric oxide reductase, subunit B  37.32 
 
 
762 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0092  nitric oxide reductase large subunit  38.69 
 
 
768 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2379  putative nitric oxide reductase norZ  37.32 
 
 
762 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2908  putative nitric oxide reductase norZ  37.32 
 
 
762 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2738  hypothetical protein  37.32 
 
 
762 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1694  putative nitric oxide reductase norZ  37.32 
 
 
762 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.732748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3822  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.19 
 
 
761 aa  465  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0625212  hitchhiker  0.000200151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1556  Nitric-oxide reductase  36.45 
 
 
787 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2680  hypothetical protein  37.18 
 
 
762 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1813  nitric oxide reductase  36.88 
 
 
762 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0109  nitric oxide reductase large subunit  39.35 
 
 
768 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.229583  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1980  Nitric-oxide reductase  36.44 
 
 
762 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187337  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0182  Nitric-oxide reductase  34.89 
 
 
776 aa  432  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1902  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  32.9 
 
 
763 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.960689  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2162  hypothetical protein  34.1 
 
 
780 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0873  Nitric-oxide reductase  31.57 
 
 
1077 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2189  hypothetical protein  34.06 
 
 
780 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2060  nitric oxide reductase  32.63 
 
 
773 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0799  nitric oxide reductase  32.63 
 
 
772 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0547  nitric oxide reductase  32.63 
 
 
772 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0658  nitric oxide reductase  32.63 
 
 
772 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.971693  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0945  nitric oxide reductase  31.56 
 
 
773 aa  323  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0472  Nitric-oxide reductase  31.02 
 
 
739 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0351  Nitric-oxide reductase  29.72 
 
 
748 aa  280  8e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000483731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0474  nitric oxide reductase  31.8 
 
 
683 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1965  nitric oxide reductase large subunit  36.4 
 
 
518 aa  247  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.575096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0502  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  28.9 
 
 
734 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1908  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  27.5 
 
 
720 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0286  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  27.06 
 
 
731 aa  189  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00622687 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2401  nitric oxide reductase large subunit-like protein protein  27 
 
 
706 aa  172  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1248  cytochrome c oxidase subunit I  25.27 
 
 
457 aa  125  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.883725  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1468  cytochrome c oxidase subunit I  28.6 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3034  Nitric-oxide reductase  25.76 
 
 
457 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2758  nitric-oxide reductase  28.27 
 
 
452 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2598  Nitric-oxide reductase  28.51 
 
 
460 aa  118  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605151  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0561  nitric-oxide reductase subunit B  27.47 
 
 
467 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000153922  normal  0.745832 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3191  cytochrome c oxidase, subunit I  26.51 
 
 
458 aa  114  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1255  nitric-oxide reductase subunit B  25.32 
 
 
463 aa  112  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0625  nitric-oxide reductase subunit B  28.72 
 
 
465 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2400  nitric-oxide reductase, B subunit, putative  27.53 
 
 
481 aa  111  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2089  nitric-oxide reductase subunit B  26.48 
 
 
448 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  25.87 
 
 
460 aa  110  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0823  nitric-oxide reductase subunit B  26.89 
 
 
456 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112554  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06830  nitric-oxide reductase subunit B  27.56 
 
 
465 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2118  cytochrome c oxidase, subunit I  28.02 
 
 
447 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4387  nitric-oxide reductase  26.03 
 
 
448 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1642  Nitric-oxide reductase  26.21 
 
 
448 aa  108  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0601  nitric-oxide reductase, B subunit  25.58 
 
 
463 aa  107  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0249  nitric-oxide reductase, large subunit  26.3 
 
 
449 aa  107  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2483  cytochrome c oxidase, subunit I  24.67 
 
 
462 aa  106  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3115  cytochrome c oxidase, subunit I  27.08 
 
 
471 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.86762  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6288  nitric-oxide reductase  26.13 
 
 
448 aa  105  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3184  nitric oxide reductase subunit B  23.93 
 
 
459 aa  102  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500001  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1984  nitric-oxide reductase subunit NorB  25.33 
 
 
474 aa  101  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000788431  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2767  Nitric-oxide reductase  24.36 
 
 
457 aa  100  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>