110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0092 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1505  nitric oxide reductase subunit B  46.28 
 
 
756 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0794416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0633  nitric oxide reductase norZ, putative  45.57 
 
 
762 aa  706    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5055  nitric oxide reductase large subunit  76.2 
 
 
761 aa  1112    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1575  nitric oxide reductase large subunit-like protein  48.24 
 
 
747 aa  712    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.362479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2802  nitric oxide reductase, subunit B  45.7 
 
 
762 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5786  putative nitric-oxide reductase  48.15 
 
 
748 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1813  nitric oxide reductase  45.96 
 
 
762 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3720  putative nitric-oxide reductase  48.92 
 
 
763 aa  702    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1886  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  46.26 
 
 
774 aa  707    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3167  nitric oxide reductase large subunit  74.87 
 
 
759 aa  1135    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0364  putative nitric-oxide reductase  49.87 
 
 
761 aa  720    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596317  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3089  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  49.25 
 
 
761 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0963858  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0883  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  49.39 
 
 
761 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0356599  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3253  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  47.2 
 
 
762 aa  700    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0846  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  48.86 
 
 
761 aa  684    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00975115  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0728  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  50.27 
 
 
758 aa  722    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1328  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  46.22 
 
 
758 aa  715    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126926  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0092  nitric oxide reductase large subunit  100 
 
 
768 aa  1563    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2379  putative nitric oxide reductase norZ  45.57 
 
 
762 aa  706    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2908  putative nitric oxide reductase norZ  45.57 
 
 
762 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2680  hypothetical protein  45.57 
 
 
762 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2738  hypothetical protein  45.7 
 
 
762 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1694  putative nitric oxide reductase norZ  45.57 
 
 
762 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.732748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0657  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  50.55 
 
 
763 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3072  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  48.98 
 
 
761 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.493365  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2413  nitric oxide reductase large subunit-like protein  47.38 
 
 
744 aa  718    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5200  putative nitric-oxide reductase  50.54 
 
 
759 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4614  nitric oxide reductase large subunit-like protein  68.77 
 
 
756 aa  1058    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0294129  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1520  nitric oxide reductase large subunit-like protein  65.65 
 
 
759 aa  1030    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3848  putative nitric-oxide reductase  47.92 
 
 
764 aa  682    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1608  hypothetical protein  60.98 
 
 
746 aa  935    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1004  putative nitric-oxide reductase  48.89 
 
 
769 aa  731    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.138313  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3044  putative nitric-oxide reductase  46.02 
 
 
767 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0283046  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1535  arginyl-tRNA synthetase (arginine--tRNA ligase; ArgRS)  60.48 
 
 
743 aa  940    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0453039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3822  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  49.8 
 
 
761 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0625212  hitchhiker  0.000200151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0761  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  49.26 
 
 
762 aa  719    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4013  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  45.96 
 
 
758 aa  699    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.23875  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3777  putative nitric-oxide reductase  48.25 
 
 
763 aa  698    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3860  putative nitric-oxide reductase  48.11 
 
 
763 aa  697    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0109  nitric oxide reductase large subunit  91.41 
 
 
768 aa  1409    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.229583  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4126  nitric oxide reductase subunit B  45.96 
 
 
758 aa  699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2550  Nitric-oxide reductase  43.89 
 
 
762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2454  Nitric-oxide reductase  43.76 
 
 
762 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1403  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  42.99 
 
 
762 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2427  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  43.64 
 
 
760 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376989  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2932  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  42.88 
 
 
758 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3493  nitric-oxide reductase subunit B  39.03 
 
 
756 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3901  nitric oxide reductase  38.23 
 
 
763 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3986  nitric oxide reductase  38.5 
 
 
762 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1556  Nitric-oxide reductase  34.94 
 
 
787 aa  452  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1569  nitric-oxide reductase subunit B  38.56 
 
 
783 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1593  nitric-oxide reductase subunit B  38.56 
 
 
783 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.718907  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1539  nitric-oxide reductase subunit B  38.56 
 
 
783 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0778717  normal  0.182091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28590  nitric oxide reductase large subunit  36.68 
 
 
840 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3178  cytochrome c oxidase, subunit I  37.94 
 
 
769 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3302  cytochrome c oxidase subunit I  38.47 
 
 
769 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195704  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0182  Nitric-oxide reductase  33.11 
 
 
776 aa  412  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0873  Nitric-oxide reductase  34.18 
 
 
1077 aa  393  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0945  nitric oxide reductase  35.11 
 
 
773 aa  379  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33419  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1980  Nitric-oxide reductase  33.06 
 
 
762 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187337  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2060  nitric oxide reductase  35.08 
 
 
773 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1902  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  32.49 
 
 
763 aa  372  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.960689  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0799  nitric oxide reductase  35.34 
 
 
772 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0547  nitric oxide reductase  35.34 
 
 
772 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0658  nitric oxide reductase  35.34 
 
 
772 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.971693  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2189  hypothetical protein  32.05 
 
 
780 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2162  hypothetical protein  31.79 
 
 
780 aa  350  4e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0472  Nitric-oxide reductase  32.5 
 
 
739 aa  342  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0351  Nitric-oxide reductase  32.37 
 
 
748 aa  302  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000483731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1965  nitric oxide reductase large subunit  40.73 
 
 
518 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.575096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0474  nitric oxide reductase  33.45 
 
 
683 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1908  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  25.5 
 
 
720 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0502  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  25.07 
 
 
734 aa  151  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0286  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  25.66 
 
 
731 aa  150  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00622687 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2401  nitric oxide reductase large subunit-like protein protein  25.07 
 
 
706 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2758  nitric-oxide reductase  29.05 
 
 
452 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1642  Nitric-oxide reductase  26.2 
 
 
448 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2400  nitric-oxide reductase, B subunit, putative  26.95 
 
 
481 aa  109  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1984  nitric-oxide reductase subunit NorB  26.43 
 
 
474 aa  107  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000788431  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0249  nitric-oxide reductase, large subunit  25.59 
 
 
449 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6288  nitric-oxide reductase  25.26 
 
 
448 aa  104  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4387  nitric-oxide reductase  25.21 
 
 
448 aa  104  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2089  nitric-oxide reductase subunit B  25.82 
 
 
448 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2483  cytochrome c oxidase, subunit I  24.57 
 
 
462 aa  99.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3034  Nitric-oxide reductase  27.08 
 
 
457 aa  92.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1248  cytochrome c oxidase subunit I  27.88 
 
 
457 aa  90.5  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.883725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2118  cytochrome c oxidase, subunit I  25.46 
 
 
447 aa  88.2  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3184  nitric oxide reductase subunit B  24.16 
 
 
459 aa  87  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500001  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0476  nitric oxide reductase  39.07 
 
 
158 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1980  cytochrome c oxidase, subunit I  24.88 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  24.54 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1516  Nitric-oxide reductase  23.7 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1968  cytochrome c oxidase, subunit I  24.43 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1468  cytochrome c oxidase subunit I  24.15 
 
 
483 aa  84  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0561  nitric-oxide reductase subunit B  24.05 
 
 
467 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000153922  normal  0.745832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0971  nitric-oxide reductase  24.17 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.838471  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0601  nitric-oxide reductase, B subunit  22.87 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0323  nitric oxide reductase large subunit, cytochrome b  24.43 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0625  nitric-oxide reductase subunit B  23.95 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06830  nitric-oxide reductase subunit B  23.95 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>