17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4863 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4863  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  371  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3150  hypothetical protein  41.89 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3059  hypothetical protein  33.94 
 
 		 626 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09026  hypothetical protein  24.71 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0409768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.14 
 
 		 412 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0895  putative NADH dehydrogenase I chain E  41.54 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2782  hypothetical protein  35.14 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.742585  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0637  hypothetical protein  27.46 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0642  hypothetical protein  27.46 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  35.19 
 
 		 398 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  38.03 
 
 		 258 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.23 
 
 		 457 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  29.36 
 
 		 385 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1723  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 446 aa  42  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2245  hypothetical protein  36.99 
 
 		 214 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  0.10945 
 
 
-
 
NC_004310  BR1789  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 440 aa  42  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1177  hypothetical protein  31.17 
 
 		 250 aa  41.2  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0930686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>