28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3105 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  643    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.245287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1644  hypothetical protein  69.89 
 
 		 285 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1728  hypothetical protein  65.73 
 
 		 265 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.718343  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1356  hypothetical protein  60.87 
 
 		 294 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4796  hypothetical protein  58.04 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5263  protein of unknown function DUF817  60.9 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5339  protein of unknown function DUF817  63.2 
 
 		 307 aa  316  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.930782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2636  hypothetical protein  60.31 
 
 		 342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3287  protein of unknown function DUF817  59.23 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6773  hypothetical protein  55.56 
 
 		 298 aa  275  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3567  hypothetical protein  59.23 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  53.97 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1090  hypothetical protein  48.53 
 
 		 281 aa  225  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1584  hypothetical protein  49.39 
 
 		 308 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6238  hypothetical protein  47.81 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1038  protein of unknown function DUF817  44.62 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1482  protein of unknown function DUF817  44.09 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000581857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3505  hypothetical protein  39.27 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3188  hypothetical protein  39.34 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1773  hypothetical protein  39.27 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000100092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3191  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000002429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3475  hypothetical protein  38.06 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3488  hypothetical protein  39.68 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000482446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3535  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3492  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3248  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000202947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3278  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000124839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0407  hypothetical protein  38.2 
 
 		 259 aa  169  8e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0304882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>