28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5339 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5339  protein of unknown function DUF817  100 
 
 
307 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.930782  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4796  hypothetical protein  87.83 
 
 
309 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5263  protein of unknown function DUF817  88.16 
 
 
309 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6773  hypothetical protein  62.69 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277117  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1356  hypothetical protein  56.12 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1728  hypothetical protein  58.04 
 
 
265 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.718343  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1644  hypothetical protein  62.75 
 
 
285 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  64.39 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3105  hypothetical protein  63.2 
 
 
324 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.245287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2636  hypothetical protein  51.94 
 
 
342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3287  protein of unknown function DUF817  52.96 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3567  hypothetical protein  52.31 
 
 
305 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1584  hypothetical protein  50.19 
 
 
308 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1090  hypothetical protein  46.18 
 
 
281 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1038  protein of unknown function DUF817  39.4 
 
 
300 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6238  hypothetical protein  45.61 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1482  protein of unknown function DUF817  43.25 
 
 
286 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000581857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3475  hypothetical protein  38.49 
 
 
254 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3191  hypothetical protein  38.1 
 
 
254 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000002429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3505  hypothetical protein  38.1 
 
 
254 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3188  hypothetical protein  38.25 
 
 
254 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1773  hypothetical protein  39 
 
 
254 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000100092  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3535  hypothetical protein  37.7 
 
 
254 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3492  hypothetical protein  37.7 
 
 
254 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3248  hypothetical protein  37.7 
 
 
254 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000202947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3278  hypothetical protein  37.7 
 
 
254 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000124839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3488  hypothetical protein  38.84 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000482446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0407  hypothetical protein  36.48 
 
 
259 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0304882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>