28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6773 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6773  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  597  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277117  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4796  hypothetical protein  61.15 
 
 
309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5263  protein of unknown function DUF817  61.15 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5339  protein of unknown function DUF817  61.79 
 
 
307 aa  343  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.930782  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1728  hypothetical protein  52.21 
 
 
265 aa  291  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.718343  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1356  hypothetical protein  53.67 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1644  hypothetical protein  54.12 
 
 
285 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3105  hypothetical protein  55.12 
 
 
324 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.245287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  59.34 
 
 
452 aa  265  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2636  hypothetical protein  48.01 
 
 
342 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3567  hypothetical protein  49.6 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3287  protein of unknown function DUF817  46.18 
 
 
305 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1584  hypothetical protein  44.58 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1482  protein of unknown function DUF817  43.36 
 
 
286 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000581857  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1090  hypothetical protein  38.19 
 
 
281 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1038  protein of unknown function DUF817  39.2 
 
 
300 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6238  hypothetical protein  42.28 
 
 
271 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3475  hypothetical protein  37.25 
 
 
254 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3505  hypothetical protein  37.65 
 
 
254 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3191  hypothetical protein  36.86 
 
 
254 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000002429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1773  hypothetical protein  36.61 
 
 
254 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000100092  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3188  hypothetical protein  37.05 
 
 
254 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3535  hypothetical protein  36.22 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3248  hypothetical protein  36.22 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000202947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3492  hypothetical protein  36.22 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3278  hypothetical protein  36.22 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000124839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3488  hypothetical protein  36.22 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000482446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0407  hypothetical protein  36.48 
 
 
259 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0304882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>