28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6238 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6238  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1482  protein of unknown function DUF817  69.92 
 
 
286 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000581857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1038  protein of unknown function DUF817  49.45 
 
 
300 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3188  hypothetical protein  47.81 
 
 
254 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1773  hypothetical protein  47.81 
 
 
254 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000100092  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3475  hypothetical protein  47.81 
 
 
254 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3505  hypothetical protein  47.01 
 
 
254 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3278  hypothetical protein  46.61 
 
 
254 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000124839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3492  hypothetical protein  46.61 
 
 
254 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3248  hypothetical protein  46.61 
 
 
254 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000202947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3535  hypothetical protein  46.61 
 
 
254 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3191  hypothetical protein  47.01 
 
 
254 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000002429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3488  hypothetical protein  47.01 
 
 
254 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000482446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1356  hypothetical protein  46.12 
 
 
294 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2636  hypothetical protein  47.83 
 
 
342 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1728  hypothetical protein  44.44 
 
 
265 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.718343  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5263  protein of unknown function DUF817  46.67 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4796  hypothetical protein  46.27 
 
 
309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3287  protein of unknown function DUF817  46.46 
 
 
305 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5339  protein of unknown function DUF817  45.6 
 
 
307 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.930782  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3567  hypothetical protein  46.09 
 
 
305 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3105  hypothetical protein  47.91 
 
 
324 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.245287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1644  hypothetical protein  43.94 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6773  hypothetical protein  42.52 
 
 
298 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277117  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1584  hypothetical protein  41.06 
 
 
308 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0407  hypothetical protein  37.74 
 
 
259 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0304882  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1090  hypothetical protein  38.43 
 
 
281 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  45.6 
 
 
452 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>