58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2813 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2813  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  184  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6294  hypothetical protein  72.73 
 
 		 82 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0748  hypothetical protein  69.62 
 
 		 81 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.262921  normal  0.873704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4514  hypothetical protein  68.89 
 
 		 90 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.775414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2638  hypothetical protein  73.33 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1859  hypothetical protein  75.32 
 
 		 78 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5140  hypothetical protein  68.67 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3195  glutathione peroxidase  71.79 
 
 		 84 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3266  hypothetical protein  72 
 
 		 87 aa  123  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2298  hypothetical protein  64.37 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.943989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0500  hypothetical protein  67.5 
 
 		 83 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  0.890091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0853  hypothetical protein  67.9 
 
 		 99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.193225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0825  hypothetical protein  65.38 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  0.202136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0785  hypothetical protein  65.38 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4147  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3664  hypothetical protein  63.75 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3469  hypothetical protein  68.49 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.521818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1898  hypothetical protein  67.12 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0434  hypothetical protein  63.16 
 
 		 82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1952  hypothetical protein  60.76 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03057  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3851  hypothetical protein  58.44 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4404  hypothetical protein  57.14 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.721221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2601  hypothetical protein  56.58 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2645  hypothetical protein  56.58 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.076199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2630  hypothetical protein  56.58 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1103  hypothetical protein  56.76 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0030  hypothetical protein  55.26 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00696955  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04775  glutathione peroxidase  55.7 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001051  hypothetical protein  55.7 
 
 		 81 aa  92.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.160342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2398  hypothetical protein  52.44 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75412  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3825  hypothetical protein  54.79 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3119  hypothetical protein  51.22 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0031  hypothetical protein  53.85 
 
 		 100 aa  90.5  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3655  hypothetical protein  51.22 
 
 		 82 aa  90.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0206  hypothetical protein  54.17 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0013  hypothetical protein  54.67 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0849  hypothetical protein  51.35 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4168  hypothetical protein  57.75 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3269  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3203  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3604  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3794  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3671  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2044  hypothetical protein  53.42 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0638  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0788  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3043  hypothetical protein  47.56 
 
 		 82 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3944  hypothetical protein  47.3 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0028  hypothetical protein  52.05 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2437  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0564  hypothetical protein, putative phage gene  50 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3493  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0628  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3325  hypothetical protein  48.78 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.880589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2512  hypothetical protein  46.58 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0485  hypothetical protein  45.95 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1352  hypothetical protein  50.91 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>