58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0500 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0500  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  0.890091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0785  hypothetical protein  81.93 
 
 
83 aa  146  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0825  hypothetical protein  81.93 
 
 
83 aa  146  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  0.202136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0748  hypothetical protein  84.62 
 
 
81 aa  140  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.262921  normal  0.873704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4514  hypothetical protein  79.75 
 
 
90 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.775414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5140  hypothetical protein  78.48 
 
 
88 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1859  hypothetical protein  74.03 
 
 
78 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3195  glutathione peroxidase  67.07 
 
 
84 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2298  hypothetical protein  63.41 
 
 
89 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.943989  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2813  hypothetical protein  67.5 
 
 
89 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3266  hypothetical protein  70.67 
 
 
87 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0434  hypothetical protein  69.74 
 
 
82 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2638  hypothetical protein  65.33 
 
 
95 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6294  hypothetical protein  64.38 
 
 
82 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1952  hypothetical protein  66.23 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0853  hypothetical protein  60.49 
 
 
99 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.193225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3664  hypothetical protein  65.28 
 
 
86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2601  hypothetical protein  62.82 
 
 
85 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2630  hypothetical protein  62.82 
 
 
85 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2645  hypothetical protein  62.82 
 
 
85 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.076199  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03057  hypothetical protein  60.26 
 
 
88 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1898  hypothetical protein  63.89 
 
 
89 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4404  hypothetical protein  64 
 
 
85 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.721221  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3469  hypothetical protein  61.11 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.521818  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04775  glutathione peroxidase  57.75 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4147  hypothetical protein  61.11 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439074  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3851  hypothetical protein  52.38 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001051  hypothetical protein  57.75 
 
 
81 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.160342  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0206  hypothetical protein  54.93 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2437  hypothetical protein  54.55 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1103  hypothetical protein  51.39 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3825  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  88.6  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2512  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3119  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83023  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0030  hypothetical protein  47.56 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00696955  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0031  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  88.2  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0849  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  87.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0028  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  87  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0013  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3655  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2398  hypothetical protein  47.22 
 
 
93 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75412  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0485  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4168  hypothetical protein  52.11 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3944  hypothetical protein  47.22 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3269  hypothetical protein  45.83 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2044  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  84.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285796  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0564  hypothetical protein, putative phage gene  45.83 
 
 
82 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.430301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3043  hypothetical protein  47.22 
 
 
82 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0788  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3794  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3671  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3203  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0638  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3604  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0628  hypothetical protein  48.61 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3493  hypothetical protein  48.61 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3325  hypothetical protein  48.61 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.880589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1352  hypothetical protein  48.61 
 
 
82 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>