58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1898 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1898  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3469  hypothetical protein  89.89 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.521818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4147  hypothetical protein  84.34 
 
 		 84 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3664  hypothetical protein  72.09 
 
 		 86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6294  hypothetical protein  69.77 
 
 		 82 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5140  hypothetical protein  67.53 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0748  hypothetical protein  68.49 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.262921  normal  0.873704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0785  hypothetical protein  68.06 
 
 		 83 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0825  hypothetical protein  68.06 
 
 		 83 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  0.202136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2813  hypothetical protein  67.12 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3266  hypothetical protein  66.22 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2638  hypothetical protein  59.3 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4514  hypothetical protein  65.28 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.775414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0500  hypothetical protein  63.89 
 
 		 83 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  0.890091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4404  hypothetical protein  61.54 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.721221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1952  hypothetical protein  54.65 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2298  hypothetical protein  59.15 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.943989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1859  hypothetical protein  58.33 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3195  glutathione peroxidase  61.11 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2601  hypothetical protein  52.33 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2645  hypothetical protein  52.33 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.076199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2630  hypothetical protein  52.33 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04775  glutathione peroxidase  55 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001051  hypothetical protein  55 
 
 		 81 aa  92  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.160342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3851  hypothetical protein  53.09 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3825  hypothetical protein  48.31 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1103  hypothetical protein  50.57 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2044  hypothetical protein  56.16 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3119  hypothetical protein  51.85 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3269  hypothetical protein  52.33 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0206  hypothetical protein  48.19 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0853  hypothetical protein  53.01 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.193225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0849  hypothetical protein  51.85 
 
 		 82 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4168  hypothetical protein  56.34 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0030  hypothetical protein  50.62 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00696955  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2398  hypothetical protein  48.84 
 
 		 93 aa  83.6  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75412  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0434  hypothetical protein  53.52 
 
 		 82 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0788  hypothetical protein  52.33 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2512  hypothetical protein  50.62 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0031  hypothetical protein  43.02 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0028  hypothetical protein  45.12 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0013  hypothetical protein  44.05 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3944  hypothetical protein  46.91 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3655  hypothetical protein  46.51 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3794  hypothetical protein  48.84 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3604  hypothetical protein  48.84 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0638  hypothetical protein  48.84 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3203  hypothetical protein  48.84 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3671  hypothetical protein  48.84 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3043  hypothetical protein  45.35 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03057  hypothetical protein  47.14 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0628  hypothetical protein  46.51 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3493  hypothetical protein  46.51 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3325  hypothetical protein  46.51 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.880589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2437  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1352  hypothetical protein  50.79 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0485  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0564  hypothetical protein, putative phage gene  39.53 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.430301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>