58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3043 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3043  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  174  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3655  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3269  hypothetical protein  82.93 
 
 		 92 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3604  hypothetical protein  82.93 
 
 		 81 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3794  hypothetical protein  82.93 
 
 		 81 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3671  hypothetical protein  82.93 
 
 		 81 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3203  hypothetical protein  82.93 
 
 		 81 aa  147  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0638  hypothetical protein  82.93 
 
 		 81 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2512  hypothetical protein  81.71 
 
 		 82 aa  146  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3944  hypothetical protein  80.49 
 
 		 82 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0788  hypothetical protein  79.27 
 
 		 81 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0485  hypothetical protein  80.49 
 
 		 82 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0849  hypothetical protein  78.05 
 
 		 82 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3325  hypothetical protein  76.83 
 
 		 81 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.880589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3493  hypothetical protein  76.83 
 
 		 81 aa  140  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2398  hypothetical protein  75.61 
 
 		 93 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75412  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3119  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0628  hypothetical protein  75.61 
 
 		 81 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0564  hypothetical protein, putative phage gene  78.05 
 
 		 82 aa  136  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2437  hypothetical protein  75.31 
 
 		 82 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3851  hypothetical protein  68.29 
 
 		 89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0030  hypothetical protein  67.07 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00696955  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3825  hypothetical protein  63.41 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1103  hypothetical protein  62.35 
 
 		 85 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0028  hypothetical protein  63.41 
 
 		 111 aa  120  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0206  hypothetical protein  62.96 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0031  hypothetical protein  61.9 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0013  hypothetical protein  61.9 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001051  hypothetical protein  64.2 
 
 		 81 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.160342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04775  glutathione peroxidase  64.2 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4168  hypothetical protein  66.2 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2044  hypothetical protein  57.32 
 
 		 82 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1352  hypothetical protein  62.2 
 
 		 82 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2638  hypothetical protein  46.34 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2298  hypothetical protein  51.22 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.943989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6294  hypothetical protein  47.56 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3195  glutathione peroxidase  45.83 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3266  hypothetical protein  49.32 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0748  hypothetical protein  47.56 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.262921  normal  0.873704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0785  hypothetical protein  48.61 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0825  hypothetical protein  48.61 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  0.202136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1859  hypothetical protein  48.61 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4514  hypothetical protein  46.34 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.775414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2813  hypothetical protein  47.56 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0500  hypothetical protein  47.22 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  0.890091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03057  hypothetical protein  49.3 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4147  hypothetical protein  43.9 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0434  hypothetical protein  47.89 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0853  hypothetical protein  48.61 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.193225  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2630  hypothetical protein  39.02 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2645  hypothetical protein  39.02 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.076199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2601  hypothetical protein  39.02 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5140  hypothetical protein  42.68 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3664  hypothetical protein  41.46 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1898  hypothetical protein  45.35 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4404  hypothetical protein  39.02 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.721221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3469  hypothetical protein  41.86 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.521818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1952  hypothetical protein  36.59 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>