11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0248 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  517  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581438  normal  0.0451182 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2456  hypothetical protein  34.11 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000527152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0421  hypothetical protein  37.37 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0187  hypothetical protein  37.89 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.928295  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3297  hypothetical protein  37.35 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0126  hypothetical protein  40.3 
 
 		 71 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2097  hypothetical protein  41.38 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000700555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1907  hypothetical protein  41.38 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1931  hypothetical protein  41.38 
 
 		 200 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0129  hypothetical protein  39.66 
 
 		 209 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2766  hypothetical protein  36.21 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272421  normal  0.705351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>