12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0421 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3297  hypothetical protein  50.75 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0248  hypothetical protein  35 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581438  normal  0.0451182 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0126  hypothetical protein  46.27 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0129  hypothetical protein  40 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2097  hypothetical protein  35.8 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000700555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2766  hypothetical protein  34.62 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272421  normal  0.705351 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0088  hypothetical protein  36.05 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1931  hypothetical protein  34.18 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.190762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1907  hypothetical protein  33.77 
 
 		 200 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0756  hypothetical protein  42.35 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000355497  normal  0.285689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>