16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1210 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1210  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1280    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1052  protein of unknown function DUF342  32.57 
 
 
642 aa  323  7e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.929442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0806  hypothetical protein  32.75 
 
 
626 aa  314  3.9999999999999997e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00357901  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1150  hypothetical protein  28.71 
 
 
638 aa  262  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216644  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0632  hypothetical protein  25.68 
 
 
618 aa  188  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.111722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0891  hypothetical protein  25.09 
 
 
619 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0821  hypothetical protein  25.09 
 
 
619 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.864118  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1210  hypothetical protein  25.51 
 
 
619 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0043  hypothetical protein  27.7 
 
 
623 aa  128  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0507  hypothetical protein  24.8 
 
 
559 aa  127  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0059  hypothetical protein  26.02 
 
 
622 aa  127  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0082  hypothetical protein  26.72 
 
 
622 aa  124  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  24.22 
 
 
611 aa  68.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  25.26 
 
 
546 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  30.04 
 
 
530 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  27.86 
 
 
529 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>