15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1052 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1052  protein of unknown function DUF342  100 
 
 
642 aa  1308    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.929442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0806  hypothetical protein  44.1 
 
 
626 aa  496  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00357901  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1150  hypothetical protein  39.26 
 
 
638 aa  424  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216644  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1210  hypothetical protein  32.57 
 
 
634 aa  323  7e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0632  hypothetical protein  29.95 
 
 
618 aa  253  6e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.111722  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0821  hypothetical protein  30.53 
 
 
619 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.864118  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0891  hypothetical protein  30.53 
 
 
619 aa  228  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1210  hypothetical protein  30.36 
 
 
619 aa  226  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0043  hypothetical protein  29.13 
 
 
623 aa  167  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0059  hypothetical protein  28.81 
 
 
622 aa  167  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0082  hypothetical protein  26.91 
 
 
622 aa  157  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0507  hypothetical protein  26 
 
 
559 aa  117  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  23.94 
 
 
611 aa  58.9  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  22.55 
 
 
530 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  26.67 
 
 
461 aa  50.4  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>