19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1150 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1150  hypothetical protein  100 
 
 
638 aa  1286    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0806  hypothetical protein  41.83 
 
 
626 aa  496  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00357901  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1052  protein of unknown function DUF342  39.26 
 
 
642 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.929442  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0632  hypothetical protein  31.54 
 
 
618 aa  324  4e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.111722  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1210  hypothetical protein  28.71 
 
 
634 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0891  hypothetical protein  31.38 
 
 
619 aa  260  6e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0821  hypothetical protein  31.38 
 
 
619 aa  259  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.864118  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1210  hypothetical protein  31.21 
 
 
619 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0059  hypothetical protein  24.15 
 
 
622 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0043  hypothetical protein  24.12 
 
 
623 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0082  hypothetical protein  23.45 
 
 
622 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0507  hypothetical protein  24.9 
 
 
559 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  22.92 
 
 
611 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  24.04 
 
 
546 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  26.01 
 
 
629 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  24.85 
 
 
530 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  25.21 
 
 
534 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  21.58 
 
 
622 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  26.55 
 
 
463 aa  44.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>